鲜全蝎含有蝎毒(Buthotoxin)、三甲胺、甜菜碱、硫磺酸，棕榈酸、软硬脂酸，胆甾醇及铵盐、卵磷脂、还含有苦味酸赅，为与蝎毒同存于毒腺中的柱状苦味酸盐，此外，尚含有蝎酸钠盐。   

蝎子油中含有棕榈酸，硬脂酸，油酸，亚油酸，亚麻酸，山嵛酸等脂肪酸，是以饱和脂肪酸为主的酸性成分。

蝎毒主要由蛋白质和非蛋白质两部分组成，蝎毒的主要活性成分是蛋白质，活性蛋白质按作用不同又分为毒性蛋白（蝎毒素）和酶，蝎毒素（Scorpion venom）是一类由20-80个氨基酸组成的含有C、H、O、N、S等元素的毒性蛋白，毒素有很高的专一性，含硫量高，分子量在6000-9000之间，但也有3000左右或大于10000。蝎毒素的分子结构中含有3～4对二硫键，其中三对构成环状核心结构，对于保持稳定性发挥神经毒性有重要意义；酶部分主要有磷酸脂酶A2、、、乙酰胆碱脂酶、透明质酸酶等。非蛋白质组成主要有脂类、有机酸、多种游离氨基酸、组织胺、5-羟色胺（5-HT）等。此外，全蝎尚含微量元素K、Na、Ca、Mg、Fe、 Cu、Zn、Mn等。

全蝎蝎毒作为主要有效成份，具有蛋白质通性，水溶液可被乙醇、硫酸铵或氯化钠浓溶液沉淀、分离、沉淀再溶于水，进行可逆沉淀反应，而强无机酸或碱、乙醚等有机溶液等作用，则产生不可逆沉淀反应即变性（Denaturation）。至于热稳定性方面意见不一，有报道蝎毒水溶液长时间放置或用100℃加热2h，则毒性减退；也有认为蝎毒水溶液100℃加热30min即被破坏。但1919年久田保晴光报告说蝎毒液热稳定性较好（100℃，30min）。 也有报道称新鲜蝎毒隔水煮沸30min其毒性基本未见破坏，即使煮沸120min，其LD50仅升高1倍左右，仍有明显的毒性。有些专家认为蝎毒及其注射剂较蜂毒注射剂更为耐热，常压下高温煮沸不易破坏。根据已测定的蝎毒素的构象来看，分子结构含有3～4对二硫键，可能较一般的蛋白稳定。另外报道认为温度和PH对毒素的稳定性影响不大，可能是毒素分子量较少的原因。